亲子鉴定str和snp检测的区别?与SNP分型相比,STR分型对样本的要求更高,相应的样本信息含量也更高,STR遗传标记重复序列为2-5个核苷酸,其中含有多个等位基因,SNP遗传标记多为二等位基因,碱基更换或颠换,这就是SNP更持久、样本要求低、检验成本低的原因;STR遗传标记可以复合扩大15-20个位点,SNP遗传标记可以复合扩大50个以上的位点,这就是为什么SNP可以检查表亲之间的亲属关系。
亲子鉴定的STR分型
STR(Short Tandem Repeat),也就是短串重复序列。STR是一种重复结构的核心序列(由2~6个碱基组成),在人类基因组中广泛存在。核心序列串联重复排列,重复次数的差异构成长度多态性。通过这种多态性的检查,我们可以清楚地区分个人和个人之间的差异,并确定他们之间的关系。一般来说,参与计算的位置是16~50个。位点越多,计算越准确,成本越高。
优点:由于其成本低、操作简便等特点,被许多机构和一些公益组织所采用。
缺陷:STR突变(0.1%)经常发生在亲子鉴定中,突变会给亲子关系的判断带来麻烦,所以在二体连测时会出现。「不排除亲子关系」观点。由于采集位置有限,无法有效支持全同胞关系以外的鉴定。
亲子鉴定SNP
SNP(Single Nucleotide Polymorphisms),即单核苷酸多态性,又称第三代遗传标记,是指单核苷酸在基因组中的变异,包括转换、变换、缺失和插入,形成大量的多态性和丰富的遗传标记。结合新一代测序技术,可以计算大量的SNP基因位点(检测位点)≥5000)准确判断亲属关系。
优点:突变率低,鉴定结果精度高,对远距离的亲缘关系也能做出可靠的判断。
缺陷:技术难度大,测序复杂,现阶段鉴定费用比STR高很多。
STR分型与SNP亲子鉴定的对比结果如下:
1.SNP具有多态性高、突变率低的特点,比STR更稳定,当STR鉴定无法得出结论时,SNP鉴定可以做出准确的答案。
2.SNP检测位点的数量远远超过STR,市场上常见的STR检测位点多为16~50个位点,而SNP检测位点则为16~50个位点。≥用于23魔方寻亲检测的5000个SNP检测量为80万。。所以能得到的信息量也远远超过STR检测。
3.十几个或者数十个位点的STR鉴定可以为亲子关系(全同胞)提供充分的依据,但是当鉴定范围扩大到更远的亲属关系时,只能依靠大量的SNP位点鉴定来提供数据。
4.SNP检验的样品质量标准低于STR。DNA将降低到极端条件,使得STR数据提取变得困难。例如,许多受害者在美国的9.11事件中因高温焚烧而无法通过SNP来确定自己的身份。
怎样用STR或SNP来判断鉴定方法?
答:一看鉴定中心提供的说明;二看鉴定点的数量。STR是十几个或几十个位点,SNP是成千上万个位点。